Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms