Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms