Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms