Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20425E9Q035 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.2 ms