Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ddx60E9PZQ1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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