Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms