Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc8E9PWG2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc8E9PWG2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms