Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gcn1E9PVA8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gcn1E9PVA8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gcn1E9PVA8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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