Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms