Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms