Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm17333C6EQI3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17333C6EQI3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17333C6EQI3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17333C6EQI3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm17333C6EQI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17333C6EQI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17333C6EQI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17333C6EQI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17333C6EQI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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