Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms