Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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