Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt4B2RU40 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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