Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms