Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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