Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms