Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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