Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms