Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms