Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms