Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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