Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms