Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms