Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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