Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms