Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ubxn8Q9QZ49 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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