Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms