Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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