Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Limd1Q9QXD8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms