Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trpc5Q9QX29 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms