Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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