Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms