Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3glb1Q9JK48 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3glb1Q9JK48 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3glb1Q9JK48 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3glb1Q9JK48 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3glb1Q9JK48 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms