Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tuba8Q9JJZ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms