Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms