Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms