Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms