Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp27a1Q9DBG1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms