Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pop5Q9DB28 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms