Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmigd1Q9D7L8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms