Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Echdc3Q9D7J9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms