Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms