Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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