Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms