Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis18aQ9CZJ6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms