Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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