Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms