Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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