Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms